1、税费计算错误与罚款：编码错误会导致税费核算错误。如果因此少缴了税款，巴西海关查实后，不仅需要补缴全额税款，还可能面临高额罚款。例如，故意低报逃税查实后，除了补税，还可能被处以罚款，罚款金额甚至可能高达货值的100%。若税差为负值或影响许可证件管理，处罚金额会以百分比计算，且与涉案货值成正比。
2、影响税收优惠：正确的NCM编码是享受Drawback（对用于出口产品的进口原材料实行税收减免、豁免或退税）等优惠制度的前提。编码错误可能导致你无法享受这些优惠，增加成本。
3、清关流程受阻：巴西的SISCOMEX系统会自动审核单证。NCM编码错误很容易触发系统的红灯审查，导致清关时间从正常的数天延长至数周甚至数月。自2025年1月启用的SISCOMEX 2.0系统，发现编码错误会触发红灯审查，延误至少5天并可能罚款。
4、产生高额滞港费：巴西港口的免费堆存期很短，清关延误会产生非常高昂的滞港费（Demurrage）和仓储费。这些额外费用可能会吞噬你的利润。
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