在巴西，双清包税服务中的低申报、灰色清关属于违规行为，一旦被查，会带来一系列严重后果。
货物相关问题：货物会被海关扣押，企业需要缴纳高额的仓储费、滞港费等。如果长时间无法解决清关问题，货物可能会因各种原因贬值甚至报废，例如一些有保质期的商品或时效性强的商品。而且，即使后续问题得到解决，清关延误也可能导致货物错过最佳销售时机，给企业带来经济损失。
经济处罚：巴西海关会对低申报的货物重新估价，并要求补缴相应的关税和增值税等税费。此外，还会根据情节轻重，处以货值一定比例的罚款，罚款金额可能是货值的 1 - 5 倍。这对于企业来说，是一笔巨大的经济负担，可能会影响企业的资金流和正常运营。
法律责任：这种违规行为属于走私范畴，情节严重时，涉事人员可能会被追究刑事责任，面临监禁等处罚。企业也可能被列入海关 “黑名单”，这将使其在未来的进出口业务中受到严格监管，甚至可能被暂停或取消进出口资格，对企业的长期发展造成致命打击。
商业信誉受损：企业的违规行为一旦曝光，商业信誉会严重受损。合作伙伴可能会对企业的诚信产生质疑，从而终止合作关系。银行等金融机构也可能对企业的信贷进行限制，政府的相关扶持政策也可能会对其关闭大门。这将使企业在市场中处于孤立无援的境地，生存空间受到极大压缩。
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