巴西海运专线的主要港口如下：
- 桑托斯港（Porto de Santos，SANTOS）：位于巴西东南沿海的桑托斯湾内，是圣保罗的外港。它是南美洲最繁忙的港口之一，也是巴西最大的港口，由桑托斯港务局管理，共有 55 个泊位。该港还是世界最大的咖啡输出港，全国有 1/3 的出口及 2/5 的进口经本港中转，主要出口货物有铁矿、糖、香蕉、棉花等，进口货物主要有小麦、机械设备、燃料等。
- 里约热内卢港（Port of Rio de Janeiro）：位于巴西东南沿海瓜纳巴拉湾西岸入口处，是巴西第二大城市和第二大海港。全港岸壁码头线总长 7500 多米，共 50 个泊位，大部分通用。该港口是一个深水港，具有极佳的地理位置优势，主要出口货物为咖啡、蔗糖、铁矿石等，进口货物主要有燃料、机器、化肥等。
- 巴拉那瓜港（Paranagua Port）：位于巴西东南沿海巴拉那瓜湾的南岸，是西大西洋沿岸的主要港口之一。港区主要码头泊位有 14 个，岸线长 2106 米，最大水深 12 米。它是巴西南部重要的海运港口，也是该国主要的谷物出口港口之一，主要出口货物为咖啡、糖、矿砂、植物油等，进口货物主要有小麦、化肥、机械等。
- 累西腓港（Porto de Recife）：位于巴西东北沿海，是巴西东北部的散糖出口港。主要工业有纺织、制糖、食品加工等。港区主要码头泊位有 17 个，岸线长 2800 米，最大水深为 10 米，港区的糖库容量达 20 万吨，谷仓容量为 5 万吨。
- 萨尔瓦多港（Porto de Salvador）：位于巴西东部沿海托多斯奥斯圣托斯湾东岸的进口处，是巴西大西洋沿岸的主要港口。主要出口货物为蔗糖、咖啡、烟草等，进口货物主要有石油、机械设备、化肥等。
